- b -

• BONUS : energy_const.h

- f -

• FILENAME_ID_LENGTH : utils.h
• FILENAME_MAX_LENGTH : utils.h
• FORBIDDEN : energy_const.h

- g -

• GASCONST : energy_const.h

- i -

• INF : energy_const.h

- k -

• K0 : energy_const.h

- m -

• MAX2 : utils.h
• MAX3 : utils.h
• MAXALPHA : data_structures.h
• MAXDOS : data_structures.h
• MAXLOOP : energy_const.h
• MIN2 : utils.h
• MIN3 : utils.h

- n -

• NBPAIRS : energy_const.h

- s -

• STR : utils.h

- t -

• TURN : energy_const.h

- v -

• VRNA_CONSTRAINT_ALL : utils.h
• VRNA_CONSTRAINT_ANG_BRACK : utils.h
• VRNA_CONSTRAINT_DOT : utils.h
• VRNA_CONSTRAINT_MULTILINE : utils.h
• VRNA_CONSTRAINT_NO_HEADER : utils.h
• VRNA_CONSTRAINT_PIPE : utils.h
• VRNA_CONSTRAINT_RND_BRACK : utils.h
• VRNA_CONSTRAINT_X : utils.h
• VRNA_CONVERT_OUTPUT_ALL : convert_epars.h
• VRNA_CONVERT_OUTPUT_BULGE : convert_epars.h
• VRNA_CONVERT_OUTPUT_DANGLE3 : convert_epars.h
• VRNA_CONVERT_OUTPUT_DANGLE5 : convert_epars.h
• VRNA_CONVERT_OUTPUT_DUMP : convert_epars.h
• VRNA_CONVERT_OUTPUT_HP : convert_epars.h
• VRNA_CONVERT_OUTPUT_INT : convert_epars.h
• VRNA_CONVERT_OUTPUT_INT_11 : convert_epars.h
• VRNA_CONVERT_OUTPUT_INT_21 : convert_epars.h
• VRNA_CONVERT_OUTPUT_INT_22 : convert_epars.h
• VRNA_CONVERT_OUTPUT_MISC : convert_epars.h
• VRNA_CONVERT_OUTPUT_ML : convert_epars.h
• VRNA_CONVERT_OUTPUT_MM_EXT : convert_epars.h
• VRNA_CONVERT_OUTPUT_MM_HP : convert_epars.h
• VRNA_CONVERT_OUTPUT_MM_INT : convert_epars.h
• VRNA_CONVERT_OUTPUT_MM_INT_1N : convert_epars.h
• VRNA_CONVERT_OUTPUT_MM_INT_23 : convert_epars.h
• VRNA_CONVERT_OUTPUT_MM_MULTI : convert_epars.h
• VRNA_CONVERT_OUTPUT_NINIO : convert_epars.h
• VRNA_CONVERT_OUTPUT_SPECIAL_HP : convert_epars.h
• VRNA_CONVERT_OUTPUT_STACK : convert_epars.h
• VRNA_CONVERT_OUTPUT_VANILLA : convert_epars.h
• VRNA_INPUT_BLANK_LINE : utils.h
• VRNA_INPUT_COMMENT : utils.h
• VRNA_INPUT_CONSTRAINT : utils.h
• VRNA_INPUT_ERROR : utils.h
• VRNA_INPUT_FASTA_HEADER : utils.h
• VRNA_INPUT_MISC : utils.h
• VRNA_INPUT_NO_REST : utils.h
• VRNA_INPUT_NO_SPAN : utils.h
• VRNA_INPUT_NO_TRUNCATION : utils.h
• VRNA_INPUT_NOSKIP_BLANK_LINES : utils.h
• VRNA_INPUT_NOSKIP_COMMENTS : utils.h
• VRNA_INPUT_QUIT : utils.h
• VRNA_INPUT_SEQUENCE : utils.h
• VRNA_OPTION_MULTILINE : utils.h
• VRNA_PLOT_TYPE_CIRCULAR : plot_layouts.h
• VRNA_PLOT_TYPE_NAVIEW : plot_layouts.h
• VRNA_PLOT_TYPE_SIMPLE : plot_layouts.h

- x -

• XSTR : utils.h