Hierarchy For Package edu.msu.cme.rdp.classifier.rrnaclassifier

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Class Hierarchy

• java.lang.Object
  • junit.framework.Assert
    • junit.framework.TestCase (implements junit.framework.Test)
      • edu.msu.cme.rdp.classifier.rrnaclassifier.ClassifierTest
      • edu.msu.cme.rdp.classifier.rrnaclassifier.HierarchyTreeTest
      • edu.msu.cme.rdp.classifier.rrnaclassifier.TrainingInfoTest
      • edu.msu.cme.rdp.classifier.rrnaclassifier.TreeFileParserTest
  • edu.msu.cme.rdp.classifier.rrnaclassifier.ClassificationResult
  • edu.msu.cme.rdp.classifier.rrnaclassifier.ClassificationResultFormatter
  • edu.msu.cme.rdp.classifier.rrnaclassifier.Classifier
  • edu.msu.cme.rdp.classifier.rrnaclassifier.ClassifierCmd
  • edu.msu.cme.rdp.classifier.rrnaclassifier.ClassifierFactory
  • org.xml.sax.helpers.DefaultHandler (implements org.xml.sax.ContentHandler, org.xml.sax.DTDHandler, org.xml.sax.EntityResolver, org.xml.sax.ErrorHandler)
    • edu.msu.cme.rdp.classifier.rrnaclassifier.TreeFileParser
  • edu.msu.cme.rdp.classifier.rrnaclassifier.GenusWordConditionalProb
  • edu.msu.cme.rdp.classifier.rrnaclassifier.GenusWordProbFileParser
  • edu.msu.cme.rdp.classifier.rrnaclassifier.HierarchyTree
  • edu.msu.cme.rdp.classifier.rrnaclassifier.HierarchyVersion
  • edu.msu.cme.rdp.classifier.rrnaclassifier.LogWordPriorFileParser
  • edu.msu.cme.rdp.classifier.rrnaclassifier.ProbIndexFileParser
  • edu.msu.cme.rdp.classifier.rrnaclassifier.RankAssignment
  • java.lang.Throwable (implements java.io.Serializable)
    • java.lang.Exception
      • java.lang.RuntimeException
        • java.lang.IllegalArgumentException
          • edu.msu.cme.rdp.classifier.rrnaclassifier.ShortSequenceException
      • edu.msu.cme.rdp.classifier.rrnaclassifier.TrainingDataException
  • edu.msu.cme.rdp.classifier.rrnaclassifier.TrainingInfo

Enum Hierarchy

• java.lang.Object
  • java.lang.Enum<E> (implements java.lang.Comparable<T>, java.io.Serializable)
    • edu.msu.cme.rdp.classifier.rrnaclassifier.ClassificationResultFormatter.FORMAT